醫院污水處理中含有大量的病原細菌、病毒和化學藥劑，成分復雜。如果不進行處理會嚴重污染水體。但是處理醫院污水并不是那么簡單的工程。因為海南醫院污水處理認為主要存在這幾大難點。
醫院污水處理設備
1、不夠重視。我國運行的醫院污水處理站處理級別整體偏低，且區域差異性較大。處理級別低會導致出水SS 偏高，嚴重影響后續消毒效果。此外，對污泥處理不夠重視，存在較大的環境風險。
2、處理工藝選擇不當。目前存在傳染病醫院污水處理采用一級強化處理+消毒工藝等污水處理工藝選擇不當情形出現，直接導致污水處理排放不達標。醫院污水大多使用含氯消毒劑進行消毒處理，且在運行中投加過量消毒劑，極易產生“三致”效應的消毒副產物。
3、自動化程度低。已建造污水處理設備的醫院中，自動化程度低，進出水水質及運行數據偏少。非智能化污水處理站，運維人員工作量較大，且現有醫院污水處理站的工作人員多為設備管理人員或者臨時工，專業運維人員少。
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